Creative Biostructure to Present at AACR Annual Meeting 2024 | April 5-10, 2024 | Booth #2953 Learn More > Close

Codon Usage Frequency Table

Escherichia coli (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.58 0.42 0.14 0.13	22.1 16.0 14.3 13.0	80995 58774 52382 47500	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.17 0.15 0.14 0.14	10.4 9.1 8.9 8.5	38027 33430 32715 31146
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.59 0.41 0.61 0.09	17.5 12.2 2.0 0.3	63937 44631 7356 989	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.46 0.54 0.30 1.00	5.2 6.1 1.0 13.9	19138 22188 3623 50991
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.12 0.10 0.04 0.47	11.9 10.2 4.2 48.4	43449 37347 15409 177210	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.18 0.13 0.20 0.49	7.5 5.4 8.6 20.9	27340 19666 31534 76644
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.57 0.43 0.34 0.66	12.5 9.3 14.6 28.4	45879 34078 53394 104171	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.36 0.36 0.07 0.11	20.0 19.7 3.8 5.9	73197 72212 13844 21552
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.49 0.39 0.11 1.00	29.8 23.7 6.8 26.4	109072 86796 24984 96695	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.19 0.40 0.17 0.25	10.3 22.0 9.3 13.7	37842 80547 33910 50269
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.49 0.51 0.74 0.26	20.6 21.4 35.3 12.4	75436 78443 129137 45459	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.16 0.25 0.07 0.04	9.9 15.2 3.6 2.1	36097 55551 13152 7607
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.28 0.20 0.17 0.35	19.8 14.3 11.6 24.4	72584 52439 42420 89265	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.18 0.26 0.23 0.33	17.1 24.2 21.2 30.1	62479 88721 77547 110308
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.63 0.37 0.68 0.32	32.7 19.2 39.1 18.7	119939 70394 143353 68609	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.35 0.37 0.13 0.15	25.5 27.1 9.5 11.3	93325 99390 34799 41277

Arabidopsis thaliana (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.51 0.49 0.13 0.22	21.9 20.7 12.6 20.9	534456 505253 308336 508909	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.28 0.13 0.20 0.10	25.0 11.1 18.1 9.2	610403 270545 440264 223500
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.52 0.48 0.36 0.20	14.8 13.9 0.9 0.5	359583 337738 22128 12250	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.59 0.41 0.44 1.00	10.4 7.1 1.1 12.5	254179 171924 26304 304101
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.26 0.17 0.11 0.11	24.2 16.1 9.9 9.9	589767 391502 240784 240472	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.38 0.11 0.33 0.17	18.7 5.3 16.2 8.5	455638 129838 393957 207684
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.61 0.39 0.56 0.44	13.7 8.7 19.3 15.2	334012 211635 470475 371091	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.17 0.07 0.12 0.09	9.0 3.8 6.3 4.8	220192 91869 152537 117195
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.41 0.35 0.24 1.00	21.7 18.6 12.5 24.4	528593 452968 305594 594807	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.34 0.20 0.30 0.15	17.7 10.4 15.7 7.7	431031 252577 381774 186589
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.52 0.48 0.48 0.52	22.3 20.9 30.7 32.8	543539 508277 749448 798966	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.16 0.13 0.35 0.20	13.9 11.2 18.8 10.9	339903 273815 457927 266406
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.41 0.19 0.15 0.26	27.4 12.8 10.0 17.4	668037 312848 242644 423929	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.44 0.16 0.27 0.14	28.6 10.4 17.6 8.9	697575 253877 427842 217886
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.68 0.32 0.52 0.49	36.7 17.2 34.3 32.3	895566 420193 836077 786970	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.34 0.14 0.37 0.15	22.4 9.2 24.3 10.2	546544 223041 592219 249165

Caenorhabditis elegan (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.50 0.50 0.12 0.23	23.9 24.0 10.2 20.1	253139 253770 107678 212079	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.21 0.13 0.25 0.15	16.8 10.7 20.4 12.1	177232 112689 215921 127964
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.56 0.44 0.44 0.17	17.6 13.7 1.6 0.6	185598 145166 16504 6683	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.55 0.45 0.39 1.00	11.2 9.1 1.4 11.0	118546 95986 14942 116700
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.24 0.17 0.09 0.14	21.1 14.9 7.9 12.1	223106 157716 83312 128045	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.18 0.09 0.53 0.20	8.9 4.5 25.9 9.6	93596 47421 273982 101820
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.61 0.39 0.66 0.34	14.1 9.2 27.2 14.2	148752 97770 287219 150209	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.21 0.10 0.23 0.09	11.3 5.2 11.9 4.7	119070 54826 126093 49450
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.53 0.31 0.16 1.00	32.4 18.9 9.6 25.9	342216 200325 101184 274027	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.33 0.18 0.34 0.15	18.9 10.5 19.8 8.9	199854 110926 209655 93703
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.62 0.38 0.59 0.41	30.3 18.4 37.9 26.0	319819 194728 400356 274667	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.15 0.10 0.29 0.08	12.1 8.3 15.5 4.0	127651 87812 163895 42185
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.39 0.22 0.16 0.23	24.0 13.6 9.9 14.3	253488 143320 104173 151285	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.36 0.20 0.31 0.13	22.3 12.6 19.6 8.2	235555 133544 207269 86490
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.68 0.33 0.62 0.38	35.5 17.1 40.6 24.4	375420 181100 429632 258278	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.20 0.12 0.59 0.08	11.0 6.7 31.5 4.5	116505 70868 332512 47074

Cricetulus griseus (CHO) (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.47 0.53 0.07 0.14	19.6 22.0 6.4 14.1	3005 3381 978 2169	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.22 0.22 0.14 0.05	16.0 16.5 10.3 3.4	2450 2529 1577 529
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.44 0.56 0.26 0.22	13.1 16.4 0.6 0.5	2017 2519 93 84	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.47 0.53 0.53 1.00	9.1 10.3 1.2 13.1	1397 1589 177 2012
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.13 0.19 0.08 0.39	13.2 18.4 7.6 38.8	2023 2818 1174 5955	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.31 0.32 0.29 0.08	16.7 17.0 15.6 4.3	2563 2608 2388 657
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.44 0.56 0.24 0.76	10.2 12.9 10.3 33.4	1563 1980 1587 5122	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.11 0.18 0.14 0.19	5.6 9.3 7.2 10.1	863 1429 1102 1558
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.35 0.51 0.14 1.00	17.4 24.8 6.9 23.0	2673 3808 1053 3538	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.26 0.37 0.29 0.08	14.1 20.3 15.7 4.5	2172 3118 2418 685
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.45 0.55 0.39 0.61	17.4 21.2 24.6 38.4	2671 3248 3782 5895	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.15 0.22 0.19 0.19	11.4 16.4 10.1 10.2	1756 2521 1557 1570
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.18 0.24 0.12 0.46	11.6 15.7 7.8 30.1	1780 2408 1202 4628	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.32 0.37 0.23 0.07	22.4 25.9 16.3 5.0	3432 3973 2497 765
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.47 0.53 0.41 0.59	24.6 28.1 28.4 41.1	3781 4310 4355 6311	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.20 0.34 0.25 0.21	12.8 21.3 15.8 13.4	1968 3268 2425 2063

Drosophila melanogaster (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.37 0.63 0.05 0.18	13.1 21.9 4.4 16.0	241160 402987 80654 294929	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.08 0.24 0.09 0.20	6.9 19.5 7.8 16.7	127758 359352 142775 307642
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.37 0.63 0.42 0.32	10.7 18.4 0.8 0.6	196987 338493 14550 11721	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.29 0.71 0.26 1.00	5.3 13.1 0.5 9.8	98056 241823 9358 181191
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.10 0.15 0.09 0.43	8.9 13.9 8.2 38.5	164079 255170 150674 709057	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.13 0.33 0.25 0.29	6.9 18.0 13.5 16.0	127584 331799 248604 293998
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.40 0.60 0.30 0.70	10.5 16.0 15.6 36.7	194039 294555 287398 674575	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.16 0.33 0.15 0.15	8.8 18.2 8.5 8.2	161800 334733 155637 151728
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.34 0.47 0.19 1.00	16.4 22.9 9.3 23.5	302063 421851 171610 431822	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.17 0.38 0.19 0.26	9.5 21.4 10.9 14.5	175261 393516 201178 267095
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.44 0.56 0.29 0.71	21.0 26.3 16.5 39.6	385441 483430 304266 729428	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.14 0.25 0.09 0.11	11.5 20.5 5.1 6.3	211452 377750 93738 115430
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.18 0.24 0.11 0.47	10.9 13.9 6.3 28.0	200189 254974 116035 514471	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.19 0.45 0.17 0.19	14.4 33.7 12.7 14.1	265295 620889 234549 259119
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.53 0.47 0.33 0.67	27.4 24.7 20.9 42.9	504880 454677 383850 789807	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.21 0.43 0.29 0.07	13.2 26.8 17.8 4.6	243460 492283 326983 85472

Human (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.45 0.55 0.07 0.13	16.9 20.4 7.2 12.6	336562 406571 143715 249879	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.18 0.22 0.15 0.06	14.6 17.4 11.7 4.5	291040 346943 233110 89429
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.43 0.57 0.28 0.20	12.0 15.6 0.7 0.5	239268 310695 14322 10915	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.45 0.55 0.52 1.00	9.9 12.2 1.3 12.8	197293 243685 25383 255512
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.13 0.20 0.07 0.41	12.8 19.4 6.9 40.3	253795 386182 138154 800774	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.28 0.33 0.27 0.11	17.3 20.0 16.7 7.0	343793 397790 331944 139414
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.41 0.59 0.25 0.75	10.4 14.9 11.8 34.6	207826 297048 234785 688316	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.08 0.19 0.11 0.21	4.7 10.9 6.3 11.9	93458 217130 126113 235938
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.36 0.48 0.16 1.00	15.7 21.4 7.1 22.3	313225 426570 140652 443795	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.24 0.36 0.28 0.12	12.8 19.2 14.8 6.2	255582 382050 294223 123533
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.46 0.54 0.42 0.58	16.7 19.5 24.0 32.9	331714 387148 476554 654280	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.15 0.24 0.20 0.20	11.9 19.4 11.5 11.4	237404 385113 228151 227281
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.18 0.24 0.11 0.47	10.9 14.6 7.0 28.9	216818 290874 139156 575438	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.26 0.40 0.23 0.11	18.6 28.5 16.0 7.6	370873 567930 317338 150708
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.46 0.54 0.42 0.58	22.3 26.0 29.0 40.8	443369 517579 577846 810842	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.16 0.34 0.25 0.25	10.8 22.8 16.3 16.4	215544 453917 325243 326879

Insect (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.25 0.75 0.07 0.20	9.2 27.3 5.7 15.9	263 786 165 458	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.19 0.24 0.16 0.12	10.8 14.1 9.2 7.2	310 405 264 208
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.25 0.75 0.68 0.15	8.1 24.1 2.8 0.6	232 694 81 18	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.35 0.65 0.17 1.00	6.9 12.8 0.7 11.3	199 369 20 325
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.13 0.22 0.08 0.31	10.3 18.1 6.1 25.2	297 521 175 724	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.29 0.31 0.24 0.16	14.3 14.8 11.5 7.9	410 425 331 226
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.32 0.68 0.39 0.61	7.9 16.6 15.2 23.3	226 476 437 671	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.25 0.24 0.08 0.05	17.2 16.4 5.5 3.4	495 472 157 98
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.29 0.59 0.12 1.00	15.1 30.4 6.0 26.8	434 873 173 770	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.27 0.36 0.21 0.16	13.8 18.5 10.7 8.2	397 531 308 235
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.29 0.71 0.31 0.69	11.7 28.3 26.0 57.2	336 814 746 1644	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.12 0.17 0.16 0.21	6.7 10.1 11.2 14.3	194 289 322 411
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.20 0.30 0.15 0.35	14.2 21.4 10.8 25.4	407 614 310 731	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.36 0.30 0.16 0.18	27.0 22.7 11.8 13.3	775 653 339 381
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.37 0.63 0.41 0.59	19.1 32.9 25.0 36.2	550 947 718 1041	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.36 0.32 0.27 0.05	23.1 20.6 17.8 3.3	663 592 511 96

Mouse (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.43 0.57 0.06 0.13	17.1 22.3 6.5 13.3	244935 319002 92974 189840	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.19 0.22 0.14 0.05	15.9 18.1 11.6 4.3	228046 258787 165371 61116
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.43 0.58 0.26 0.22	12.2 16.5 0.6 0.5	175198 236579 8861 7491	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.48 0.52 0.52 1.00	11.1 12.1 1.2 12.4	158573 173509 17004 177261
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.13 0.20 0.08 0.39	13.2 20.3 8.0 40.0	188236 290198 114707 571592	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.30 0.31 0.28 0.10	18.3 18.4 17.1 6.3	261478 262874 244064 89477
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.40 0.60 0.25 0.75	10.2 15.2 11.4 34.0	145279 217261 163794 486041	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.09 0.18 0.12 0.19	4.7 9.5 6.6 10.3	66962 136330 94626 147905
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.34 0.50 0.16 1.00	15.6 23.2 7.2 23.1	223528 332072 103441 330431	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.25 0.35 0.29 0.11	13.6 19.2 15.9 5.8	194120 274588 227958 82653
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.43 0.57 0.39 0.61	15.5 20.7 21.3 33.7	221760 296083 305128 482643	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.15 0.24 0.21 0.22	12.3 19.5 11.4 11.7	176056 279098 163062 167166
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.17 0.25 0.12 0.46	10.7 15.7 7.4 29.1	152706 224465 105532 416428	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.29 0.38 0.23 0.10	20.1 26.4 15.8 6.6	288132 378142 226309 94463
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.44 0.56 0.40 0.60	21.1 26.6 26.5 39.4	301359 380355 379216 563999	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.18 0.33 0.26 0.23	11.5 21.9 16.9 15.4	164971 312846 241435 220474

Nicotiana tabacum (Tabacco) (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.58 0.42 0.14 0.24	24.4 17.8 12.5 21.9	10395 7569 5334 9315	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.26 0.14 0.23 0.07	20.3 10.7 17.7 5.4	8634 4542 7543 2290
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.57 0.43 0.41 0.19	17.8 13.5 1.1 0.5	7573 5737 486 224	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.57 0.43 0.41 1.00	9.9 7.6 1.1 11.6	4233 3225 455 4921
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.26 0.14 0.10 0.12	23.7 12.2 9.2 10.4	10079 5176 3935 4431	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.37 0.13 0.40 0.10	18.8 6.7 20.0 4.9	8012 2862 8540 2098
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.61 0.39 0.58 0.42	13.3 8.6 21.3 15.5	5650 3672 9069 6618	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.15 0.08 0.11 0.08	7.4 4.0 5.1 3.7	3173 1688 2179 1573
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.50 0.25 0.25 1.00	27.3 13.7 13.9 24.8	11626 5823 5914 10543	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.39 0.19 0.33 0.09	20.8 10.0 17.4 4.6	8844 4251 7420 1946
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.60 0.40 0.49 0.51	27.4 18.6 32.3 33.9	11684 7922 13750 14437	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.17 0.13 0.32 0.26	13.3 10.0 15.5 12.5	5657 4262 6586 5309
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.41 0.17 0.17 0.25	27.0 11.4 11.2 16.6	11505 4855 4755 7057	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.44 0.17 0.31 0.08	32.0 12.6 23.0 5.8	13610 5373 9805 2490
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.68 0.32 0.55 0.45	36.7 16.9 35.0 29.1	15612 7219 14896 12401	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.34 0.17 0.34 0.15	23.1 11.4 23.5 10.5	9831 4854 10006 4482

Pichia pastoris (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.56 0.44 0.15 0.33	23.9 19.1 14.9 31.4	1013 810 634 1332	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.29 0.20 0.19 0.09	23.5 16.3 15.6 7.2	996 693 663 305
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.45 0.55 0.53 0.29	14.7 18.3 0.9 0.5	622 777 38 21	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.65 0.35 0.18 1.00	8.3 4.5 0.3 9.9	353 191 13 418
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.17 0.08 0.12 0.16	16.0 7.6 11.2 15.3	677 321 475 648	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.35 0.16 0.40 0.10	15.3 6.7 17.1 4.1	648 285 725 172
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.54 0.46 0.62 0.38	10.5 8.9 23.9 14.5	447 378 1015 616	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.16 0.05 0.11 0.05	6.9 2.3 4.6 2.2	291 99 195 93
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.51 0.31 0.18 1.00	31.7 19.3 11.5 19.2	1347 819 486 813	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.40 0.24 0.25 0.11	23.3 13.7 14.3 6.3	989 580 605 267
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.48 0.52 0.47 0.53	23.5 25.7 30.2 34.4	998 1090 1280 1460	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.15 0.09 0.47 0.16	12.1 7.4 19.9 6.6	514 315 846 281
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.42 0.23 0.16 0.20	26.7 14.5 10.1 12.8	1131 615 430 543	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.45 0.25 0.24 0.06	29.6 16.7 15.9 3.7	1256 707 675 158
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.59 0.41 0.58 0.42	37.2 26.2 40.2 29.6	1578 1110 1706 1255	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.43 0.14 0.32 0.10	26.6 8.6 20.0 6.4	1130 365 849 271

Pig (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.38 0.62 0.06 0.10	16.5 27.2 6.7 10.7	9682 15970 3904 6291	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.15 0.26 0.15 0.06	11.0 18.6 10.9 4.1	6467 10920 6395 2415
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.35 0.65 0.13 0.08	11.1 20.5 0.7 0.4	6509 12028 384 250	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.39 0.61 0.79 1.00	8.8 13.6 4.2 13.8	5189 8002 2462 8101
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.10 0.21 0.13 0.40	10.5 22.5 13.6 42.8	6171 13175 7968 25098	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.24 0.35 0.27 0.13	14.3 20.6 15.9 7.7	8418 12079 9337 4531
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.34 0.66 0.25 0.75	8.3 16.1 10.6 31.6	4850 9423 6208 18519	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.07 0.22 0.12 0.20	3.7 10.9 6.1 10.3	2174 6370 3607 6054
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.30 0.53 0.18 1.00	16.5 29.3 10.0 21.2	9653 17201 5874 12424	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.19 0.41 0.26 0.13	10.9 23.2 14.9 7.3	6379 13626 8768 4263
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.37 0.63 0.40 0.60	14.2 24.2 20.6 30.7	8328 14191 12102 18000	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.12 0.26 0.19 0.20	8.2 18.3 9.4 9.9	4802 10718 5490 5805
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.14 0.27 0.12 0.48	9.0 17.1 7.4 30.9	5261 10030 4343 18102	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.24 0.45 0.20 0.11	16.4 30.7 13.9 7.7	9606 18003 8161 4491
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.38 0.62 0.38 0.62	17.2 28.5 23.1 37.4	10082 16733 13534 21938	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.14 0.36 0.26 0.24	9.5 24.7 17.4 16.3	5569 14478 10200 9552

Rat (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.41 0.59 0.06 0.12	16.5 24.0 5.6 12.4	67342 97917 22946 50586	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.18 0.23 0.14 0.06	14.5 18.1 10.7 4.4	59379 73906 43498 17938
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.40 0.60 0.27 0.23	11.7 17.6 0.6 0.5	47581 71817 2487 2003	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.45 0.56 0.50 1.00	9.7 12.1 1.1 13.3	39593 49606 4323 54121
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.12 0.21 0.07 0.42	12.1 20.7 7.3 41.2	49547 84406 29920 168065	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.30 0.32 0.27 0.11	17.1 18.3 15.8 6.4	69680 74530 64570 26151
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.38 0.62 0.25 0.75	9.2 14.9 10.8 33.0	37758 60682 44091 134878	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.09 0.18 0.12 0.20	4.9 10.0 6.6 10.7	20024 41025 27045 43511
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.32 0.54 0.14 1.00	15.5 25.6 6.7 23.7	63414 104432 27251 96623	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.23 0.37 0.28 0.12	12.8 20.3 15.1 6.4	52394 82782 61774 26019
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.40 0.60 0.37 0.63	15.1 22.5 20.8 35.0	61847 92081 84916 142997	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.15 0.25 0.20 0.21	11.6 19.4 10.6 11.5	47538 79105 43324 47066
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.16 0.26 0.11 0.47	10.2 16.7 7.0 30.4	41475 68342 28503 124205	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.28 0.40 0.22 0.10	19.5 27.6 15.3 6.9	79794 112838 62476 28040
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.42 0.58 0.39 0.61	20.8 28.4 26.3 40.5	84969 116171 107203 165509	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.17 0.34 0.25 0.24	11.3 22.4 16.6 15.8	46093 91387 67691 64344

Saccharomyces cerevisiae (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.59 0.41 0.28 0.29	26.1 18.4 26.2 27.2	170666 120510 170884 177573	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.26 0.16 0.21 0.10	23.5 14.2 18.7 8.6	153557 92923 122028 55951
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.56 0.44 0.48 0.22	18.8 14.8 1.1 0.5	122728 96596 6913 3312	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.63 0.37 0.30 1.00	8.1 4.8 0.7 10.4	52903 31095 4447 67789
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.13 0.06 0.14 0.11	12.3 5.4 13.4 10.5	80076 35545 87619 68494	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.31 0.15 0.42 0.12	13.5 6.8 18.3 5.3	88263 44309 119641 34597
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.64 0.36 0.69 0.31	13.6 7.8 27.3 12.1	89007 50785 178251 79121	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.14 0.06 0.07 0.04	6.4 2.6 3.0 1.7	41791 16993 19562 11351
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.46 0.26 0.27 1.00	30.1 17.2 17.8 20.9	196893 112176 116254 136805	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.35 0.22 0.30 0.14	20.3 12.7 17.8 8.0	132522 83207 116084 52045
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.59 0.41 0.58 0.42	35.7 24.8 41.9 30.8	233124 162199 273618 201361	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.16 0.11 0.48 0.21	14.2 9.8 21.3 9.2	92466 63726 139081 60289
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.39 0.21 0.21 0.19	22.1 11.8 11.8 10.8	144243 76947 76927 70337	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.38 0.22 0.29 0.11	21.2 12.6 16.2 6.2	138358 82357 105910 40358
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.65 0.35 0.70 0.30	37.6 20.2 45.6 19.2	245641 132048 297944 125717	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.47 0.19 0.22 0.12	23.9 9.8 10.9 6.0	156109 63903 71216 39359

Streptomyces (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.02 0.98 0.00 0.02	0.4 25.9 0.1 2.4	1234 72059 179 6779	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.01 0.41 0.02 0.28	0.6 20.2 1.1 13.7	1803 56276 3013 38183
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.05 0.95 0.03 0.17	1.0 19.5 0.1 0.5	2727 54303 395 1479	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.09 0.91 0.80 1.00	0.7 7.1 2.4 15.1	2004 19634 6617 42057
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.02 0.36 0.00 0.60	1.6 36.6 0.4 60.9	4459 101750 997 169359	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.02 0.41 0.02 0.54	1.5 25.4 1.3 33.3	4294 70794 3746 92793
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.07 0.93 0.05 0.95	1.7 21.8 1.4 25.3	4740 60728 3759 70449	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.07 0.47 0.03 0.38	5.5 39.2 2.6 31.8	15259 108957 7181 88441
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.02 0.96 0.02 1.00	0.6 27.6 0.7 15.8	1759 76866 1850 43995	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.02 0.65 0.03 0.31	1.2 39.8 1.6 18.9	3330 110711 4581 52727
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.04 0.96 0.05 0.95	0.7 16.3 1.1 19.7	2002 45375 2959 54924	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.03 0.25 0.01 0.04	1.5 12.4 0.8 3.7	4219 34568 2165 10191
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.02 0.55 0.03 0.41	1.5 46.9 2.7 34.9	4063 130645 7402 97199	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.02 0.57 0.04 0.36	3.1 78.4 5.6 49.4	8535 218103 15633 137587
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.05 0.95 0.15 0.85	3.1 58.2 8.7 48.4	8523 162110 24291 134604	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.10 0.64 0.08 0.19	9.2 61.0 7.2 18.1	25651 169647 19941 50450

Yeast (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.59 0.41 0.28 0.29	26.1 18.2 26.4 27.1	147662 103110 149466 153307	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.26 0.16 0.21 0.10	23.6 14.2 18.8 8.6	133502 80612 106266 48524
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.56 0.44 0.48 0.24	18.8 14.7 1.0 0.5	106420 83100 5596 2681	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.63 0.37 0.29 1.00	8.0 4.7 0.6 10.3	45222 26520 3516 58416
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.13 0.06 0.14 0.11	12.2 5.4 13.4 10.4	68959 30501 75775 59027	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.31 0.15 0.41 0.12	13.6 6.8 18.2 5.3	77061 38414 103062 29916
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.64 0.36 0.69 0.31	13.7 7.8 27.5 12.2	77724 44082 155751 68932	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.15 0.06 0.07 0.04	6.5 2.6 3.0 1.7	36693 14645 17111 9872
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.46 0.26 0.27 1.00	30.2 17.1 17.8 20.9	171272 96735 100930 118274	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.35 0.22 0.30 0.13	20.3 12.6 17.8 7.9	114746 71204 100680 44995
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.59 0.41 0.58 0.42	36.0 24.9 42.2 30.8	204015 141103 239186 174250	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.16 0.11 0.48 0.21	14.2 9.7 21.3 9.2	80293 54825 120587 52322
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.39 0.21 0.21 0.19	22.0 11.6 11.8 10.6	124665 65664 66649 60286	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.38 0.22 0.29 0.11	21.1 12.5 16.2 6.1	119402 71065 91502 34754
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.65 0.35 0.71 0.29	37.8 20.3 45.9 19.1	214363 114918 260082 108411	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.47 0.19 0.22 0.12	23.9 9.7 10.9 6.0	135417 54977 61825 33885

Zea mays (maize) (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.37 0.63 0.08 0.15	13.9 24.1 7.8 13.7	10405 18021 5819 10227	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.17 0.22 0.15 0.14	12.6 15.8 11.1 9.9	9418 11779 8270 7391
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.37 0.63 0.24 0.32	10.7 18.6 0.6 0.8	7989 13868 447 568	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.34 0.66 0.44 1.00	6.0 11.6 1.1 13.1	4502 8650 828 9747
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.18 0.25 0.08 0.25	16.4 23.6 7.8 23.6	12255 17598 5856 17602	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.24 0.24 0.26 0.26	13.4 13.3 14.2 14.5	10004 9946 10609 10802
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.43 0.57 0.39 0.61	10.6 13.9 15.0 23.0	7896 10355 11189 17187	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.12 0.23 0.09 0.15	6.6 13.1 4.9 8.6	4912 9761 3662 6442
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.33 0.47 0.20 1.00	16.0 22.8 9.4 23.7	11943 17033 7049 17706	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.24 0.33 0.22 0.21	12.0 16.2 10.7 10.2	8958 12066 7987 7650
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.40 0.60 0.30 0.70	14.7 21.8 16.8 39.5	10987 16252 12567 29494	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.11 0.21 0.16 0.25	8.3 15.2 9.2 14.1	6219 11381 6855 10527
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.24 0.29 0.11 0.36	16.4 19.9 7.2 24.5	12238 14896 5370 18314	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.25 0.33 0.19 0.23	22.4 29.3 16.6 20.9	16694 21904 12429 15610
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.44 0.56 0.36 0.64	23.8 30.5 21.8 39.4	17764 22752 16250 29427	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.21 0.39 0.20 0.21	15.2 28.2 14.5 15.1	11380 21059 10838 11275

Creative Biostructure has been working in the field of structural biology, membrane protein technologies, and structure-based drug discovery. Feel free to discuss your research project with our experts.

Recommended Services & Products

Stochastic Optical Reconstruction Microscopy (STORM) Service

Co-crystallization

Magic-Angle Spinning (MAS) Solid-state NMR Service

Circular Dichroism Spectroscopy Service

Confocal Raman Microscope Service